无芒雀麦是一种营养价值高、适口性好的优质牧草，探究无芒雀麦耐盐的分子机制对进一步研究盐的关键响应基因和耐盐无芒雀麦的分子育种有着重要的作用。但是与无芒雀麦对盐胁迫响应的分子调控相关的的报道较少。
8188cc威尼斯张博教授团队联合中国农科畜牧所的庞永珍团队利用PacBio Iso-Seq技术首次构建了300mM NaCl盐胁迫下无芒雀麦不同时间的全长转录组数据库。第三代全长转录组测序产生了19.67G 个聚合酶读数碱基，这些碱基被组装成355836 个全长转录组，平均长度为2542 bp。通过比较第三代测序和第二代测序的结果，共获得了116,578 个差异表达基因。GO和KEGG富集分析表明，叶和根的多种通路被激活。此外，研究还实时定量PCR 验证了10个盐胁迫响应基因的表达模式，与RNA-Seq 检测到的表达模式一致（图2）。本研究采用NGS 和 SMRT 测序技术，生成了无芒雀麦的全长转录组。同时，还发现了一组可能参与无芒雀麦盐耐的关键基因。这些测序数据将有助于今后研究无芒雀麦的基因功能特征和盐分适应机制。
图1：（A）lllumina和SMRT测定的基因数量分布图；（B）lllumina和SMRT测定的基因长度分布图
图2：无芒雀麦耐盐性所涉及的信号转导模型
文章信息：Qian L ,Jiaxing S ,Yi Z , et al. Full-Length Transcriptomics Reveals Complex Molecular Mechanism of Salt Tolerance in Bromus inermis L.[J]. Frontiers in plant science,2022,13.
原文链接：https://doi.org/10.3389/fpls.2022.917338.