筛选苜蓿HAK家族的关键候选基因可用于苜蓿的功能研究和分子育种,为进一步的分子水平功能研究和苜蓿的分子育种奠定了基础。
8188cc威尼斯张博教授团队联合中国农业科学院北京畜牧兽医研究所庞永珍研究员团队通过家族分析在紫花苜蓿基因组中确定了22个HAK基因。系统发育分析表明,这些HAK蛋白可分为4个进化枝,同一亚群的成员具有相似的基因结构和保守的基序。在它们的启动子区域发现了许多与防御和胁迫相关的顺式作用元件。此外,基因芯片和转录组数据分析的基因表达谱显示,这些HAK基因在不同组织中表现出不同的表达模式,并响应盐和干旱处理。共表达分析表明,6个同源HAK 核心基因对参与了直接的网络相互作用。RT-qPCR结果表明,6对HAK基因在NaCl和甘露醇处理下均有不同程度的诱导表达。RT-qPCR检测MsHAK 1/2/11的表达水平与转录组数据呈显著正相关。本研究结果表明,HAK基因在苜蓿对各种非生物胁迫的响应中起着关键作用,HAK基因可用于苜蓿的功能研究和分子育种的候选基因。
图1 苜蓿HAK基因的表达谱
文章信息:Qian Li,Wenxuan Du,Xinge Tian,Wenbo Jiang,Bo Zhang,Yuxiang Wang,Yongzhen Pang.Genome-wide characterization and expression analysis of the HAK gene family in response to abiotic stresses in Medicago.(2022)
原文链接:https://doi.org/10.1186/s12864-022-09009-2